フィニアスとファーブのセカンドシーズンは39話（1時間の、102部構成と54個のエピソード）で構成されていた。これは、最初のディズニーXDで示された後、ディズニーXDは一連の新しいホームであると考えられているように米国のディズニー・チャンネルで放送されています。しかし、オスの魔法使い後に、エピソードは再びディズニー・チャンネルで初公開し始めた。
エピソード[]
- レーク・ノーズ・モンスター
- ペリーの気持ちホンヤク機／世界に広めよう！靴ひもの先端
- 巨大キャンディスあらわる／裏庭水族館
- 悪のゼリーモンスター／名探偵キャンディス
- 許されぬまばたき／カモノハシ・レストランでデート
- ペリーが卵を産んだ！／テレビゲームの世界へようこそ
- ミープの隠された真実
- 弟たちの発明対決／史上最大の飛行機づくり
- クイズにチャレンジ／ドライブは洗車場
- 帰ってきて！ペリー／フィニアス一家漂流記
- ベスト・ソング・カウントダウン
- タイムマシンで大騒ぎ
- ミクロでかくれんぼ／ロマンチック豪華クルーズ
- ザ・バルジートルズ／巨大ストアで争奪戦
- かわいいウサギにご用心／はじめてのスパ・デー
- シャボン玉ボーイズ／イザベラ 樹液の伝説
- キャンディスを励まそう／ファイヤーサイド・ガールズへの道
- ガキ大将のおきて／ファインディング・メアリー
- 謎の物体をさぐれ／伝説の都市アトランティス
- 写真で瞬間移動／ファーブのマネマネ・ダンストロン
- ロボット緊急出動／スージーの休戦宣言
- フィニアスとファーブのクリスマス・バケーション（クリスマス特別エピソード）
- カールの潜入捜査／3つの州の統一記念日
- 何でも通り抜けマシン／カンペキな結婚式
- ファーブ支配者の侵略／なつかしの最新ロケット
- オスの魔法使い
- ザ・ビーク
- フィニアスとファーブに大変身／キャンディスの告げ口作戦
- カメレオンのスティーブ／裏庭でロボット・ロデオ
- 成功へのキーワード／満月をなくそう
- キャンディスの一日市長／レモネードとベストフレンド
- 巨大迷路で大冒険／80年代復活コンサート
- SFファンタジー集会
- ハワイでバケーション
- キャンディスが2人！？／ベッドで風邪をふきとばせ！
- キャンディス、王女になる／キャンディス大ピンチ！？
- フィニアスとファーブ 夏はキミのもの！
- ジェットコースター ザ・ミュージカル